התפרצות מגפת הקורונה בחודש מרץ 2020 השפיעה על התיירות בכל העולם. הגבולות הבין-לאומיים של ישראל נסגרו כמעט לחלוטין (פרט לתיירים עם אישורים מיוחדים) והפעילות התיירותית במלונות הייתה בעיקר של אורחים מישראל. פעילות המלונות בארץ דעכה והופסקה כמעט לחלוטין מאמצע חודש מרץ עד לימים האחרונים של חודש מאי 2020. באמצע חודש ספטמבר, לפני תחילתם של חגי תשרי, הוכרז על סגר שני בארץ (סגר הוכרז מערב ראש השנה 18/09/2020 עד סוף חגי תשרי 11/10/2020).
המלונות נשארו סגורים כמעט לחלוטין עד אמצע חודש נובמבר, אז התקבל החוק של "איי תיירות ירוקים" באילת ובאזור המלונות של ים המלח . הכניסה לאזורים האלה התאפשרה רק עם הצגת בדיקת קורונה (PCR) שלילית, והמלונות קיבלו אישור לפעול במתכונת הרגילה תחת המגבלות של ה"תו הסגול".
בשאר הארץ המלונות נשארו סגורים או פעלו רק במתכונת מצומצמת של השכרת חדרים ללא שירותים נוספים כמו מסעדות, מכוני כושר ובריכות. בסוף 2020 הוכרז על סגר שלישי ובוטלו ה"איים הירוקים". בין ה-8 בינואר 2021 לשבוע השני של פברואר נוספו מגבלות להידוק הסגר, ורק חלק קטן מהמלונות המשיך לפעול במתכונת מצומצמת של השכרת חדרים. מאמצע חודש פברואר אושרו הקלות רבות: מלונות חזרו לפעול במגבלות מסוימות. בחודשים מרץ-יוני 2021 מלונות חזרו לפעילות בהדרגה.
סך הפדיון בינואר-יוני 2021 הסתכם ב-2.6 מיליארד שקלים, לעומת 5.9 מיליארד שקלים בתקופה המקבילה ב- 2019. רק כ-3% מהפדיון הגיע מתיירים ו-97% מהפדיון התקבל מישראלים. זאת לעומת שנת 2019 שבה הפדיון התחלק כמעט שווה בשווה בין תיירים לישראלים. הפדיון מישראלים במחצית הראשונה של 2021 התקבל ברובו ממלונות באילת וים המלח (53%). 14% נוספים מהפדיון מישראלים, התקבל מהמלונות בתל אביב וירושלים.
בפדיון מישראלים במחצית הראשונה של השנה לעומת אותה תקופה ב-2019, במחירים קבועים נרשמה עלייה (של 2.5%) רק בעיר טבריה. ירידה קטנה יחסית נרשמה באילת (4.5%), ובשאר המקומות נרשמו ירידות גדולות יותר: 12% בים המלח, 45% בתל אביב-יפו ויותר מ-50% בנתניה וירושלים. בחישוב ארצי הירידה בפדיון מישראלים הגיעה ל-20%.
הפדיון מתיירים במחצית הראשונה של 2021 היה נמוך במיוחד והיה רק אחוזים בודדים מהפדיון מתיירים שנרשם במחצית הראשונה של 2019. בעקבות הירידה הדרמטית בפדיון מתיירים והירידה של 20% בפדיון מישראלים, סך הפדיון במחצית הראשונה של 2021 היווה פחות ממחצית הפדיון שנרשם באותה תקופה בשנת 2019 (ירידה של 56% במחירים קבועים). לפי ערים, הירידה בסך הפדיון נעה בין ירידה של 15%באילת ל-87% במערב ירושלים.
במחצית הראשונה של שנת 2021 מספר המשרות, הכולל את העובדים דרך חברות כוח אדם, במלונות התיירות הגיע ל-17.3 אלף בממוצע לחודש בלבד. זאת לעומת 40.8 אלף ב-2019.
עקב הירידות החדות שנרשמו בנתונים החל מחודש מרץ 2020 ,חושבו רק אומדנים מנוכי עונתיות, ולא חושבו אומדני מגמה. לפי נתונים מנוכי עונתיות, בפדיון מישראלים ברבע הראשון נרשם פדיון של 144 מיליון ש"ח ממוצע לחודש, לעומת 594 מיליון ש"ח ברבע השני. בפדיון מתיירים, ברבע הראשון נרשם פדיון של 6 מיליון ש"ח בלבד בממוצע לחודש לעומת 18 מיליון ש"ח ברבע השני.